南京医科大学有硕士点，南京医科大学现共有76个硕士点。
| 学科代码 | 专业名称 | 招生院系 |
|---|---|---|
| 45400 | 应用心理 | 第四临床医学院 |
| 86001 | 生物技术与工程 | 康复医学院 |
| 86002 | 制药工程 | 康复医学院 |
| 105200 | 口腔医学 | 第一临床医学院 |
| 105200 | 口腔医学 | 口腔医学院 |
| 105200 | 口腔医学 | 第三临床医学院 |
| 105200 | 口腔医学 | 医学影像学院 |
| 105200 | 口腔医学 | 附属淮安第一医院 |
| 105200 | 口腔医学 | 金陵临床医学院 |
| 105200 | 口腔医学 | 连云港临床医学院 |
| 105300 | 公共卫生 | 公共卫生学院（一） |
| 105300 | 公共卫生 | 公共卫生学院（二） |
| 105400 | 护理 | 护理学院 |
| 105400 | 护理 | 护理学院 |
| 105500 | 药学 | 药学院 |
| 105500 | 药学 | 药学院 |
| 125200 | 公共管理 | 医政学院 |
| 125200 | 公共管理 | 医政学院 |
| 30505 | 思想政治教育 | 马克思主义学院 |
| 40203 | 应用心理学 | 第四临床医学院 |
| 71003 | 生理学 | 基础医学院 |
| 71005 | 微生物学 | 基础医学院 |
| 71006 | 神经生物学 | 基础医学院 |
| 71007 | 遗传学 | 基础医学院 |
| 71009 | 细胞生物学 | 基础医学院 |
| 71009 | 细胞生物学 | 逸夫医院 |
| 71010 | 生物化学与分子生物学 | 基础医学院 |
| 77700 | 生物医学工程 | 康复医学院 |
| 77901 | 流行病与卫生统计学 | 公共卫生学院（二） |
| 83100 | 生物医学工程 | 康复医学院 |
| 100101 | 人体解剖与组织胚胎学 | 基础医学院 |
| 100102 | 免疫学 | 基础医学院 |
| 100103 | 病原生物学 | 基础医学院 |
| 100104 | 病理学与病理生理学 | 基础医学院 |
| 100105 | 法医学 | 基础医学院 |
| 100301 | 口腔基础医学 | 口腔医学院 |
| 100302 | 口腔临床医学 | 口腔医学院 |
| 100401 | 流行病与卫生统计学 | 公共卫生学院（一） |
| 100402 | 劳动卫生与环境卫生学 | 公共卫生学院（一） |
| 100403 | 营养与食品卫生学 | 公共卫生学院（一） |
| 100404 | 儿少卫生与妇幼保健学 | 公共卫生学院（一） |
| 100405 | 卫生毒理学 | 公共卫生学院（一） |
| 100506 | 中医内科学 | 第一临床医学院 |
| 100701 | 药物化学 | 药学院 |
| 100702 | 药剂学 | 药学院 |
| 100704 | 药物分析学 | 药学院 |
| 100706 | 药理学 | 基础医学院 |
| 100706 | 药理学 | 药学院 |
| 100706 | 药理学 | 第三临床医学院 |
| 101000 | 医学技术 | 第一临床医学院 |
| 101000 | 医学技术 | 第四临床医学院 |
| 101000 | 医学技术 | 康复医学院 |
| 101000 | 医学技术 | 医学影像学院 |
| 101100 | 护理学 | 护理学院 |
| 120400 | 公共管理 | 医政学院 |
| 1001J4 | 生殖医学 | 基础医学院 |
| 1001J4 | 生殖医学 | 医学影像学院 |
| 1001J4 | 生殖医学 | 生殖医学国家重点实验室 |
| 1002J1 | 人文医学 | 马克思主义学院 |
| 1007Z1 | 临床药学 | 药学院 |
| 1004Z2 | 社区医学与健康教育学 | 公共卫生学院（一） |
| 0779Z1 | 卫生检验学 | 公共卫生学院（二） |
南京医科大学简介：
南京医科大学是国家“双一流”建设高校，首批教育部、国家卫生健康委与江苏省人民政府共建医学院校，教育部高水平公共卫生学院建设高校，江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院，抗战时期更名为国立江苏医学院。1957年，由镇江迁至南京，更名为南京医学院。1962年，被列为全国首批六年制医药院校。1981年，被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，更名为南京医科大学。学校建有江宁校区和五台校区，校本部有教职工1900多人。
