培养目标不同
会计硕士简称MPAcc，是专业型硕士，偏重于职业教育，主要培养学生的实务操作能力，解决实际工作中问题的能力，以及会计工作的领导能力，以自费培养模式为主。毕业多在各大公司、企业、会计事务所等单位从事会计相关工作。
会计学硕士是学术型硕士，侧重基础教育、素质教育和专业教育，偏重会计理论知识的掌握和学习，以公费和委托培养为主，自费情况较少，并设置有大量的奖学金。毕业多在教育事业单位或机构从事教学、科研等相关工作。
学习方式不同
会计硕士的学习方式有全日制和非全日制两种，全日制需要脱产，周一到周五全天在校学习，非全日制是在职学习，有周末班、集中班两种上课方式可自行选择。
会计学硕士只有全日制一种学习方式，学习期间不允许正式入职。
初试科目不同
会计硕士初试考英语二和管理类联考综合。管理综合满分200分，其中数学考察初等数学不含高等数学，占75分；逻辑推理以选择题为主，占60分；写作占65分，一篇论证有效性分析30分，一篇论说文35分。英语二考试难度介于四、六级之间，满分100分。
会计学硕士初试考试科目有：政治（满分100分），英语一（满分100分），数学三（满分150分），会计学或管理学（满分150分）。
